Pcr multiplex come funziona?

Domanda di: Mariapia Caputo  |  Ultimo aggiornamento: 13 gennaio 2022
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Chiamata PCR Multiplex, la tecnica è specializzata nell'individuare mutazioni all'interno di un gene utilizzando delle sonde molecolari marcate con molecole fluorescenti (fluorocromi). «Sono queste ultime a identificare le varianti», ha soiegato il virologo.

Come si fa la PCR?

La PCR consiste in 3 passaggi che vengono ripetutamente ciclicamente da una macchina per PCR: denaturazione, ricottura e estensione, con quest'ultima che di fatto moltiplica materialmente il DNA. Ognuna di queste fasi può essere lunga 20-30 secondi e venire ripetuta più di 30 volte, a seconda del protocollo.

Per cosa si usa la PCR?

In genere, l'obiettivo della PCR è quello di produrre copie di sequenze bersaglio da analizzare o utilizzare in qualche altro modo. il DNA amplificato mediante PCR può essere inviato per il sequenziamento, visualizzato mediante elettroforesi su gel, o clonato in un plasmide per ulteriori esperimenti.

A cosa serve la nested PCR?

La nested PCR permette di aumentare la specificità (e/o sensibilità) della reazione di PCR. Nella nested PCR una aliquota della reazione originale è utilizzata come stampo per una seconda reazione (nested) partendo da una coppia di primer complementari a regioni presenti all'interno del primo prodotto amplificato.

Come funziona Sybr green?

Il Sybr Green dye è una molecola fluorescente che durante la reazione di PCR Real time si intercala all'interno del doppio filamento di DNA originatosi ad ogni ciclo di amplificazione. Nella fase di denaturazione il Sybr green è libero nella miscela di reazione.

Aula sobre PCR multiplex



Trovate 19 domande correlate

Come si calcola il delta ct?

  1. Calcolo il ∆CT.
  2. ∆CT = CT medio GENE TARGET – CT medio GENE HOUSEKEEPING.
  3. Calcolo il ∆∆CT.
  4. ∆∆CT = ∆CT campione INCOGNITO – ∆CT campione scelto come CONTROLLO.
  5. Calcolo il FOLD change.
  6. Fold change = 2-∆∆Ct.

A cosa serve il termociclatore?

Il termociclatore (thermocycler) è uno strumento di laboratorio in grado di condurre automaticamente le determinate variazioni cicliche di temperatura necessarie all'amplificazione enzimatica di sequenze di DNA in vitro attraverso la reazione a catena della polimerasi (PCR).

A cosa serve elettroforesi su gel?

L'elettroforesi del gel è una tecnica ampiamente usata nei laboratori di scienze biologiche per separare le macromolecole quali DNA, RNA e proteine. In questa tecnica, le molecole sono separate hanno basato sulla loro dimensione e carica elettrica.

Cosa significa oligonucleotidi?

Gli oligonucleotidi sono brevi (oligo) sequenze di nucleotidi (RNA o DNA), tipicamente con 20 o meno paia di basi. La loro produzione viene solitamente affidata a sintetizzatori automatici, che possono produrne in modo efficiente fino ad una lunghezza di 160/200 basi.

Cosa sono gli enzimi di restrizione ea cosa servono?

In sostanza gli enzimi di restrizione, che si trovano in molti procarioti dove hanno il ruolo di spezzare molecole di DNA estraneo, sono delle endonucleasi che catalizzano la scissione di entrambi i filamenti di DNA in corrispondenza di una specifica sequenza nucleotidica.

Quali elementi sono indispensabili per la PCR?

L'amplificazione mediante PCR consente di ottenere in vitro molto rapidamente la quantità di materiale genetico necessaria per le successive applicazioni.
...
L'enzima
  • concentrazione dei nucleotidi,
  • concentrazione del magnesio,
  • temperatura di "melting"
  • temperatura di annealing.

A cosa serve una libreria genomica?

Una libreria genomica è un insieme di segmenti di DNA provenienti dal genoma di un individuo di una data specie. Ogni segmento è trasportato di solito da un plasmide o da un fago. Le librerie genomiche sono utilizzate per clonare un particolare gene contenuto nel genoma della specie da cui è stata ottenuta la libreria.

Come si amplifica il DNA?

Si utilizza una procedura detta PCR (polymerase chain reaction). Il DNA da amplificare viene mescolato con una soluzione contenente gli enzimi polimerasi, che catalizzano la replicazione, e una grande quantità di nucleotidi, che sono i “mattoncini” del DNA.

Che cos'è la tecnica del DNA ricombinante?

È una porzione di Dna (la molecola elicoidale che contiene le informazioni genetiche) nella quale è stato introdotto un gene che appartiene a un organismo estraneo e che contiene le informazioni necessarie per stimolare (o anche inibire) la produzione di una particolare proteina.

Come si Sequenzia il DNA?

I frammenti di DNA ottenuti vengono analizzati attraverso una tecnica chiamata elettroforesi, durante la quale un raggio laser mette in evidenza i marcatori e i rispettivi colori; grazie ad essi è possibile stabilire (attraverso un computer) l'esatto ordine dei nucleotidi del frammento di DNA e ottenere così il ...

Come funzionano gli oligonucleotidi antisenso?

L'oligonucleotide antisenso si lega all'RNA messaggero, o a sequenze di controllo dell'espressione genica presenti sul filamento complementare di DNA, impedendo così la decodificazione ed il successivo processo di sintesi proteica.

Cosa sono i Desossiribonucleotidi Trifosfati?

DNTP (o dNTP) è una sigla che indica un generico deossinucleoside trifosfato. La sua struttura è analoga a quella dei nucleotidi solitamente incorporati nella doppia elica di DNA. Per la precisione si tratta della forma di nucleotide che la DNA polimerasi utilizza nella formazione della catena.

Quali sono i tre componenti di un nucleotide?

Ogni nucleotide è costituito da tre componenti (gruppo fosfati, zucchero pentoso e base azotata). Lo zucchero di riferimento è il desossiribosio, che può legarsi a quattro basi azotate differenti: adenina, timina, guanina e citosina.

Quando si realizza un elettroforesi su gel in base a quale parametro il sistema riesce a separare i componenti del campione?

A pH neutro, il DNA è carico negativamente grazie alla presenza dei gruppi fosfato; poiché le cariche opposte si attraggono, i frammenti di DNA migrano verso il polo positivo del campo elettrico. ...

A cosa serve il gel di agarosio?

L'elettroforesi su gel di agarosio è una tecnica classicamente utilizzata per analizzare e separare acidi nucleici. Questa tecnica sfrutta le cariche presenti nelle molecole di DNA o RNA (caricate negativamente) per farle migrare, in un campo elettrico, attraverso un gel di agarosio.

Quando si realizza un elettroforesi in base a quale parametro il sistema riesce a separare i componenti del campione?

L'elettroforesi è una tecnica che utilizza un campo elettrico per separare e visualizzare frammenti di DNA in base al loro peso molecolare ed alla loro carica. Gli acidi nucleici, migrano sempre verso il polo positivo per la presenza, nella loro molecola, della carica negativa data dai gruppi fosfato.

Cosa si intende per denaturazione del DNA?

la denaturazione (denaturation) della doppia elica del DNA stampo in due sin- goli filamenti (a temperature superiori a 90°C) per rottura dei ponti idrogeno che tengono appaiate le basi complementari; 2.

Quanto costa un termociclatore?

Un termociclatore standard costa mediamente 3-4000€, mentre un termociclatore per Real-time PCR parte in genere dai 10-15000€ fino a cifre ben più alte.

Quando avviene lo splicing alternativo?

L'espressione di un gene può essere regolata anche subito dopo che il gene è stato trascritto. Il principale processo durante il quale può avvenire questa regolazione è la maturazione del pre-mRNA che abbiamo descritto nel paragrafo precedente.

A cosa serve l amplificazione del DNA?

È detta anche reazione a catena della polimerasi, in inglese Polymerase Chain Reaction (PCR). L'amplificazione genica è utilizzata per la ricerca e la diagnosi di determinate malattie, in tutti quei casi in cui si rende necessario individuare o analizzare un acido nucleico.

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